영주 소수서원 고문서 일괄 중 조직·운영 자료는 한국 서원의 임원 조직 체제, 입원자격과 입록 방법 등이 설정 되어 있고, 강학 자료에서는 서원 교육의 형태와 절차, 운영 방식 등을 구체적으로 확인할 수 있다. ‘도동곡’은 제향의례에 제향자와 연관된 가사가 포함된 한국에서 유일한 사례이며, 33책의 방대한 심원록은 서원의 위상과 네트워크를 추적할 수 있다. 잡록 등 치부류는 소수서원의 역사 전반이 수록되어 있다. 아울러 서원의 경제 기반 확대, 서원의 도서관 역할, 관권과의 친밀성, 서원운영과 향사례, 영정 개모 일기 등 한국서원 역사와 운영 양상을 종합적으로 파악할 수 있는 중요한 자료들이 망라되어 있다. 즉 소수서원의 고문서는 한국 서원의 역사 그 자체를 함축하고 있는 종합 보고서라 할만 하다.