조사본 ｢대불정여래밀인수증요의제보살만행수능엄경｣은 고려 충선왕 1년(1309)에 간행된 판본으로 자획(字劃)이 분명하고 묵색(墨色)도 선명하고 좋은 점으로 미루어 판각된 직후에 인출된 초인본(初印本)으로 추정된다. 특히 조사본 ｢대불정여래밀인수증요의제보살만행수능엄경｣에는 처음부터 끝까지 순독구결(順讀口訣)의 토가 기입되어 있어서 그 특징을 잘 보여주고 있다. 고려 말부터 조선 초기까지 구결이 적어도 3종이 전하는데 이 책에 있는 구결이 가장 이른 시기의 구결이라는 평가를 받는다. 이는 훈민정음 이전의 국어사 연구를 위한 귀중한 자료라 평가되고 있다. 따라서 조사본 ｢대불정여래밀인수증요의제보살만행수능엄경｣은 비록 훼손상태는 심하나 고려 판본으로 초인본(初印本)이며, 훈민정음 이전의 국어사 연구를 위한 귀중한 자료이다.